microbiome傻傻分不清

Microbiota 微生物群

 

微生物群是指琢磨动植物体上共生或病理的微生物生态群落。微生物群包括细菌、古菌、原生动物、真菌和病毒。探讨注脚其在宿主的免疫、代谢和激素等方面非凡重大。近义词Microbiome微生物组即包括微生物,又包括其基因组

 

Metagenomics 宏基因组

 

宏基因是指直接讨论环境样品作为遗传学材料。广义来説其包括环境基因组、生态基因组学和群体基因组学。传统的微生物学和微生物基因测序倚重于单克隆的培养,早期环境基因测序克隆16s
rRNA基因等特定基因来确定自然样品中的生物多样性。此方法将会挂一漏万大量末被作育的微生物多样性。目前琢磨采取鸟枪法或PCR间接测序方法来取得样品群体中保有成员无偏好的基因。因为这类方法可以呈现在此往日不可能察觉的微生物多样性,由此宏基因组方法提供了开拓性的工具去精通大家一切生活的社会风气。随着测序价格的骤降,宏基因组允许微生物生态探究比在此以前更大的原则和更多细节

 

Microbiome 微生物组

 

WiKi认为其与Microbiota同义,均为Microbiota词条。但实在这七个词分别仍然很有些,看下图。

 

上边这篇Nature的Review,用图片的形式对这六个词举行了定义和描述,让大家来读书一下:

微生物 1

图1. 本综述中对微生物群、宏基因组和微生物组的概念。

每张图代表的是一样的部落,可是不同的措施可以定义此群体可提供的不等新闻。

 

微生物,a. 微生物群:选取16S rRNA探讨格局鉴定此条件中微生物的体系。

b. 宏基因组:微生物群的基因和基因组,包括质粒、强调群体的遗传学潜能。

c. 微生物组:微生物群的基因和基因组,以及微生物群的产物与宿主环境。

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